日明貿易は、明の皇帝に 朝貢 してその返礼を受ける形で行われていました。
貿易の際に派遣される遣明船は、当時沿岸で略奪をしていた 倭寇 との区別のため、明から交付された 勘合 を用いていました。
この勘合をチェックして、倭寇でないことが証明されないと、貿易ができませんでした。

1392年に 李成桂 が建国した朝鮮との交易（日朝貿易）は、対馬の 宗氏 を通じて行われました。
交易は、1419年に朝鮮軍が対馬を襲撃した 応永の外寇 により一時的に中断した後、嘉吉条約で再び活発になりました。
しかし、1510年に 三浦の乱 が起きたことで、貿易は再び衰退しました。

古くから北海道（蝦夷地）に住んでいた アイヌ は、北海道の南部に進出していた和人（日本人）と交易を行っていました。
しかし、アイヌの人々は取引の不平等や和人（日本人）の傲慢な態度に耐えかね、大首長 コシャマイン を中心に蜂起し、 コシャマインの戦い が起きました。